1927年11月，籌設(shè)社會科學(xué)研究所，并于1928年5月正式成立，下有法制組、民族組、經(jīng)濟組、社會組，前兩組在南京，后兩組在上海。

1928年6月9日，在上海成立的國立中央研究院（簡稱中研院，拉丁文譯名Academia Sinica）在上海成立，是為u201c中華民國最高學(xué)術(shù)研究機關(guān)u201d，是中國歷史上第一個真正意義上的u201c科學(xué)院u201d（academy），直屬于南京國民政府，首任院長蔡元培。創(chuàng)辦中研院的主要成員是中國科學(xué)社社員，因此，中研院成立后繼承了中國科學(xué)社在國際上作為中國科學(xué)界官方代表的地位。

1934年7月，中華教育文化基金董事會之北平社會調(diào)查所并入該所，1945年改稱社會研究所。

1928年，歷史語言研究所（簡稱史語所）成立。年初，大學(xué)院中央研究院籌備委員傅斯年向大學(xué)院院長蔡元培建議設(shè)置歷史語言研究所。3月，中研院于廣州中山大學(xué)籌設(shè)歷史語言研究所，聘傅斯年、顧頡剛、楊振聲三人為常務(wù)籌備員。7月，正式成立，由傅斯年代行所長職務(wù)。10月22日，遷入廣州柏園，始有獨立所址，后經(jīng)議定，以此日為所慶紀(jì)念日。初在廣州，分設(shè)史料、漢語、文籍考訂、民間文藝、漢字、考古、人類學(xué)及民物學(xué)、敦煌材料研究等八組。

1929年，院址遷往北平，將原設(shè)八組歸并為三個學(xué)術(shù)組，一為歷史學(xué)組，從事史學(xué)及文籍考訂；二為語言學(xué)組，從事語言學(xué)及民間藝文；三為考古學(xué)組，從事考古學(xué)、人類學(xué)及民物學(xué)，并分別聘請陳寅恪、趙元任、李濟為一、二、三組主任。九一八事變（1931）后由北平遷上海。

1934年，中研院在南京之建筑陸續(xù)竣工，史語所亦由上海遷至南京。同年5月增設(shè)人類學(xué)組。中日戰(zhàn)爭期間，史語所先遷湖南長沙，繼遷云南昆明，最后定居于四川南溪縣李莊之板栗坳。

1946年，遷回南京，繼續(xù)推動各項研究工作，并接收北平東方文化研究所及近代科學(xué)圖書館圖書，成立u201c北平圖書史料整理處u201d。

1948年3月，召開年會，選舉確定了81名中央研究院第一屆院士，其中人文組院士28人，占到院士總數(shù)的三分之一強。在中央研究院1948年評選出的第一屆81位院士中，人文組院士達28位，占到院士總數(shù)的三分之一。

1949年9月27日，中國人民政治協(xié)商會議第一屆全體會議一致通過《中華人民共和國中央人民政府組織法》。據(jù)此，在政務(wù)院之下設(shè)科學(xué)院，行使管理全國科學(xué)研究事業(yè)的政府行政職能?？茖W(xué)院與文化部、教育部、衛(wèi)生部、出版總署等部門同受政務(wù)院文化教育委員會的指導(dǎo)。10月19日，中央人民政府委員會第三次會議任命文學(xué)家、考古學(xué)家、歷史學(xué)家、原中央研究院院士郭沫若為中國科學(xué)院院長。11月1日，中國科學(xué)院在北京開始辦公。^[3]成立之初的中國科學(xué)院也是一個集自然科學(xué)和人文社會科學(xué)于一身的綜合性研究機構(gòu)。

1949年11月5日，中國科學(xué)院從華北人民政府高等教育委員會處接管了原北平研究院的史學(xué)研究所以及原中央研究院歷史語言研究所設(shè)在北京的圖書史料整理處，并在原中央研究院歷史語言研究所歷史組、考古組以及北平研究院史學(xué)所的基礎(chǔ)上，成立了中國科學(xué)院考古研究所；在原中央研究院歷史語言研究所語言組的基礎(chǔ)上成立了中國科學(xué)院語言研究所。

1950年4月6日，中國科學(xué)院又于在南京接收了原中央研究院的社會研究所，在此基礎(chǔ)上成立了中國科學(xué)院社會研究所，初設(shè)于南京。5月，由解放區(qū)遷北平的華北大學(xué)研究部歷史研究室劃入中國科學(xué)院，在此基礎(chǔ)上擴建為中國科學(xué)院近代史研究所。上述考古所、語言所、社會所、近代史所成為中國科學(xué)院最早設(shè)立的一批人文社會科學(xué)研究機構(gòu)。

1954年1月28日，周恩來總理主持政務(wù)院第204次政務(wù)會議，決定建立中國科學(xué)院學(xué)部和實行學(xué)部委員制度。中國科學(xué)院組織全國科技、教育、產(chǎn)業(yè)界的學(xué)者、專家，并會同有關(guān)部門推薦遴選了首批委員人選。^[4]

1956年，國家在制定12年科學(xué)技術(shù)發(fā)展遠景規(guī)劃的同時，也制定了《哲學(xué)社會科學(xué)規(guī)劃草案（1956~1967）》，推動了院屬哲學(xué)社會科學(xué)研究機構(gòu)的發(fā)展，很快建立了幾個新的研究所。到u201c文革u201d之前，哲學(xué)社會科學(xué)部有14個研究機構(gòu)，包括哲學(xué)所、經(jīng)濟所、世界經(jīng)濟所、文學(xué)所、外國文學(xué)所、語言所、歷史所、近代史所、世界歷史所、考古所、民族所、法學(xué)所、世界宗教所和情報所。1957年6月，反右斗爭開始，同年7月院黨組提出成立哲學(xué)社會科學(xué)部分黨組，以加強黨的領(lǐng)導(dǎo)，并提出該部學(xué)術(shù)思想方面的問題由中共中央宣傳部直接領(lǐng)導(dǎo)，8月中宣部批復(fù)同意。隨著政治運動的不斷升級，以及全院科技力量投入u201c兩彈一星u201d等重大科技攻關(guān)任務(wù)，哲學(xué)社會學(xué)部逐步從中國科學(xué)院分離出來。

1960年，哲學(xué)社會科學(xué)部劃歸中宣部直接領(lǐng)導(dǎo)。

1961年以后，院屬機構(gòu)中不再列入該學(xué)部所屬研究所。但哲學(xué)社會科學(xué)部及其所屬單位仍與中國科學(xué)院有著種種聯(lián)系。

1966年，全國開始u201c文革u201d后，學(xué)部工作限于停頓狀態(tài)。

1967年1月，各自然科學(xué)類學(xué)部被迫停止活動。哲學(xué)社會科學(xué)部亦遭嚴(yán)重破壞，是u201c文革u201d重災(zāi)區(qū)。學(xué)部內(nèi)派性嚴(yán)重，冤案成堆，若干人被迫害致死。由于中宣部被砸亂，哲學(xué)社會科學(xué)部長期處于無政府狀態(tài)。

1969年以后，絕大部分人員下放農(nóng)村參加勞動。

1972年，由于周總理的過問，院部才回到北京，逐步恢復(fù)工作，學(xué)部由國務(wù)院科教組代管。

1975年，四屆全國人大召開恢復(fù)教育部后，學(xué)部交由教育部代管。

1975年初，鄧小平受命主持國務(wù)院工作，他不僅全面整頓科學(xué)事業(yè)，也著手恢復(fù)遭受嚴(yán)重破壞的哲學(xué)社會科學(xué)。鄧小平?jīng)Q定由新設(shè)立的國務(wù)院政治研究室代管學(xué)部業(yè)務(wù)工作，學(xué)部的政治和行政工作分別由國務(wù)院政工組、辦公室負責(zé)。7月16日國務(wù)院發(fā)布學(xué)部領(lǐng)導(dǎo)機構(gòu)名單，郭沫若仍任學(xué)部主任，并組成學(xué)部臨時領(lǐng)導(dǎo)小組負責(zé)學(xué)部日常工作。7月下旬起派到學(xué)部的軍宣隊、工宣隊陸續(xù)撤離，學(xué)部下放農(nóng)村的研究人員被召回，研究所科研業(yè)務(wù)逐步恢復(fù)。

1975年9月，國務(wù)院公布《國務(wù)院關(guān)于哲學(xué)社會科學(xué)若干事項的通知》（國發(fā)[1975]142號）。通知中規(guī)定，中國科學(xué)院哲學(xué)社會科學(xué)部u201c直接受國務(wù)院指導(dǎo)，其地位同于科學(xué)院，相當(dāng)于部委一級單位u201d。該《通知》正式提出了建立單獨的社會科學(xué)院的計劃。由此學(xué)部行政級別大為提高，但名稱未變，相關(guān)研究所名義上仍留在中科院。10月4日，胡耀邦被鄧小平任命為中科院u201c黨的核心領(lǐng)導(dǎo)小組u201d第一副組長后，在牽頭制定中科院整頓規(guī)劃時，也開始為建立單獨的中國社會科學(xué)院制定規(guī)劃。10月25日，鄧小平在政治局會議上受到批判，在所謂u201c反擊右傾翻案風(fēng)u201d的運動中，政研室一度險被撤銷。

1976年1月17日，因鄧小平在政治局會議上受到批判，宣布不再領(lǐng)導(dǎo)哲學(xué)社會科學(xué)部的工作，社會科學(xué)院的建設(shè)計劃被迫中止。

1976年秋，u201c四人幫u201d被粉碎后，哲學(xué)和社會科學(xué)文化事業(yè)在撥亂反正中逐步復(fù)蘇。

1977年4月5日，中科院哲學(xué)社會科學(xué)部向中央遞交《關(guān)于哲學(xué)社會科學(xué)學(xué)部改變名稱的請示報告》。5月7日，中共中央批準(zhǔn)了該報告，決定將中國科學(xué)院哲學(xué)社會科學(xué)部改名為u201c中國社會科學(xué)院u201d，地位與中國科學(xué)院等同，相當(dāng)于部委一級。學(xué)部時期的14個研究所全部劃歸過去。至此，哲學(xué)社會科學(xué)部正式從中國科學(xué)院獨立出去。11月24日，國務(wù)院頒發(fā)的u201c中國社會科學(xué)院u201d印章正式啟用。隨后，中央任命馬克思主義理論家、政論家、社會科學(xué)家、中國科學(xué)院哲學(xué)社會科學(xué)部學(xué)部委員胡喬木出任中國社會科學(xué)院第一任院長兼黨組書記。

1977年至1981年期間，中國社會科學(xué)院先后成立了工業(yè)經(jīng)濟研究所、農(nóng)村發(fā)展研究所、財貿(mào)經(jīng)濟研究所（現(xiàn)為財經(jīng)戰(zhàn)略研究院）、新聞研究所（現(xiàn)為新聞與傳播研究所）、馬克思列寧主義毛澤東思想研究所（現(xiàn)為馬克思主義研究院）、社會學(xué)研究所、人口研究所（現(xiàn)為人口與勞動經(jīng)濟研究所）、少數(shù)民族文學(xué)研究所（現(xiàn)為民族文學(xué)研究所）、世界政治研究所（后與世界經(jīng)濟研究所合并成立世界經(jīng)濟與政治研究所）、美國研究所、日本研究所、西歐研究所（現(xiàn)為歐洲研究所）以及中國社會科學(xué)雜志社、中國社會科學(xué)出版社、中國社會科學(xué)院研究生院和郭沫若著作編輯出版委員會辦公室等16個研究和出版單位。此外，蘇聯(lián)東歐研究所（現(xiàn)為俄羅斯東歐中亞研究所）、西亞非洲研究所和拉丁美洲研究所也在這個時期劃歸中國社會科學(xué)院。^[5]

1993年國務(wù)院機構(gòu)改革，中國社會科學(xué)院是國務(wù)院的直屬事業(yè)單位，是中國哲學(xué)社會科學(xué)的最高學(xué)術(shù)機構(gòu)和全國社會科學(xué)綜合研究中心。^[6]

1988年國務(wù)院機構(gòu)改革，中國社會科學(xué)院保留，為國務(wù)院的直屬事業(yè)單位。^[6]

2004年1月5日，中共中央印發(fā)《關(guān)于進一步繁榮發(fā)展哲學(xué)社會科學(xué)的意見》。

2005年12月26日，中國社會科學(xué)院在馬克思列寧主義毛澤東思想研究所的基礎(chǔ)上，成立了中國社會科學(xué)院馬克思主義研究院。

2006年8月3日，中國社會科學(xué)院學(xué)部成立，作為院務(wù)會議領(lǐng)導(dǎo)下的學(xué)術(shù)指導(dǎo)、學(xué)術(shù)咨詢和科研協(xié)調(diào)機構(gòu)。中國社會科學(xué)部設(shè)立了文學(xué)史學(xué)哲學(xué)部（后又分立為文學(xué)哲學(xué)部、歷史學(xué)部）、經(jīng)濟學(xué)部、社會政法學(xué)部、國際研究學(xué)部、馬克思主義研究學(xué)部，評選出首屆學(xué)部委員47人、榮譽學(xué)部委員95人。

2007年5月，中國社會科學(xué)院建院二十周年。^[7]

2011年3月，中國社會科學(xué)院正式啟動u201c哲學(xué)社會科學(xué)創(chuàng)新工程u201d。是年11月30日，實施創(chuàng)新工程后成立的首批跨學(xué)科、綜合性、創(chuàng)新型學(xué)術(shù)思想庫和新型研究結(jié)構(gòu)u2014u2014中國社會科學(xué)院財經(jīng)戰(zhàn)略研究院、中國社會科學(xué)院亞太與全球戰(zhàn)略研究院、中國社會科學(xué)院社會發(fā)展戰(zhàn)略研究院，分別在財政與貿(mào)易經(jīng)濟研究所、亞洲與太平洋研究所和社會發(fā)展研究所的基礎(chǔ)上組建而成。

2012年4月26日，中國社會科學(xué)院研究生院新校區(qū)在北京市房山區(qū)的良鄉(xiāng)高教園區(qū)正式落成。

2015年1月，中共中央辦公廳、國務(wù)院辦公廳印發(fā)《關(guān)于加強中國特色新型智庫建設(shè)的意見》提出，u201c發(fā)揮中國社會科學(xué)院作為國家級綜合性高端智庫的優(yōu)勢，使其成為具有國際影響力的世界知名智庫u201d。^[8]

2016年11月26日至29日，中國社會科學(xué)院院長、學(xué)部主席團主席王偉光率院學(xué)部委員學(xué)術(shù)調(diào)研團前往山東青島，青島市政府與中國社會科學(xué)院簽訂了戰(zhàn)略合作意向書。

2017年1月7日，青島市政府與中國社會科學(xué)院在北京簽署全面戰(zhàn)略合作協(xié)議。根據(jù)協(xié)議，雙方將共同建設(shè)高等院校，合作共建青島研究院，聯(lián)合在青島舉辦國際性高層論壇，為青島市重大決策和發(fā)展戰(zhàn)略提供咨詢論證，在人才交流與培養(yǎng)方面展開全面合作。