第一階段：起步營運階段(1993－1994年)

本階段的主要任務是： 完成全區(qū)海關(guān)隔離設(shè)施及u201c七通一平u201d基礎(chǔ)設(shè)施建設(shè)，部分倉庫、寫字樓、商品貿(mào)易展示街、 臨時碼頭等公用及商用建筑物建成并投入使用，形成高標準的投資經(jīng)營環(huán)境； 倉儲區(qū)及金融貿(mào)易區(qū)的建設(shè)全面鋪開；打通國內(nèi)外招商渠道，大規(guī)模進行項目引進； 主要政策落實到位，內(nèi)外部體制關(guān)系基本理順；建立一個集中、精簡、高效、廉潔的行政管理體系； 服務體系基本形成，為全區(qū)提供全面優(yōu)質(zhì)服務。

第二階段：功能發(fā)揮階段(1995－1996年)

本階段的主要任務是：繼續(xù)完成部分倉庫、 寫字樓的建設(shè)，使大部分規(guī)劃建設(shè)項目竣工；重點發(fā)揮國際貿(mào)易功能、商品櫥窗功能， 使之形成廣州保稅區(qū)的重要特色；其它各項功能開始發(fā)揮，形成基本架構(gòu)；汽車、 生產(chǎn)資料、高檔日用品、電子產(chǎn)品、金銀首飾等一批有形專業(yè)市場建成營運，并具備國際化、 規(guī)范化的管理水平；管理機構(gòu)的運作趨于成熟，主要政策以立法形式加以確定。

第三階段：功能完善階段(1997－　)

本階段的主要任務是完善各項功能，使保稅區(qū)整體功能得以發(fā)揮； 以組合方式擴大保稅區(qū)地域面積。這個階段，全區(qū)一片繁榮，內(nèi)外客商云集， 貨物集散規(guī)模大，經(jīng)濟效益顯著， 一個高度開放的符合國際標準的綜合性自由貿(mào)易區(qū)崛起在黃埔港區(qū)，構(gòu)成廣州國際化大都市的一個重要組成部分， 成為廣州經(jīng)濟國際化的重要標志之一。